Існує два методи стерилізації медичних інструментів, які використовуються в хірургії, а саме високотемпературна стерилізація та низькотемпературна стерилізація.
1. Метод високотемпературної стерилізації полягає у використанні високої температури для денатурації мікробних білків для досягнення мети знищення бактерій. Він найбільш широко використовується в клінічній практиці, і зазвичай використовується стерилізація парою під тиском, яка підходить для інструментів і предметів, які можуть витримувати високу вологість і тепло. Існує також швидка стерилізація парою, яку можна використовувати для голих інструментів і предметів.
По-друге, низькотемпературна стерилізація, часто з використанням стерилізації окисом етилену. Найбільш клінічне застосування, перевага полягає в тому, що він не пошкоджує стерилізовані предмети, має сильну проникаючу здатність і добре знищує мікроорганізми. Стерилізацію парою формальдегіду при низькій температурі можна використовувати для медичних виробів, які не витримують високих температур.
